Jonatan berjumpa Prannoy di pertandingan pertama BWF World Tour Final, Rabu (20/1/2021). Unggulan enam itu kalah tiga gim dengan skor 21-18, 16-21, dan 21-23.

Meski menang di awal gim pertama, Jonatan tidak menampilkan permainan terbaiknya. Setelah unggul 4-1, Jonatan sering melakukan kesalahan sendiri.

Bahkan selepas interval pertama, ia sempat kehilangan lima poin karena bola yang selalu menyangkut di net imbas permainan yang terburu-buru.

Saat posisi 17-17, Jonatan mendapat tambahan satu angka setelah bola yang dipukul India out. Setelah itu, Jonatan menutup laga 21-18 usai mendapat dua dari kesalahan pemain India.

Memasuki gim kedua di Toyota Thailand Open 2021, menjadi lebih sengit. Setelah imbang 3-3, India mendapat dua poin yang salah satunya dari kegagalan challenge yang dilakukan Jonatan.

Jonatan terus tertinggal hingga kedudukan 3-7. Jonatan sejatinya bisa memperkecil jarak jika bola yang dipukulnya tidak dinyatakan fault oleh umpire. Prannoy membuat kedudukan 8-4 menjadi 11-8 pada interval kedua.
Prannoy semakin di atas angin. Ia meninggalkan jauh Jonatan dengan selisih delapan poin, kedudukan menjadi 18-10, kemudian 19-11.

Jonatan membuat kedudukan menjadi 16-19 berhasil merebut lima poin. Tapi servis Jonatan yang terlalu pendek membuat Prannoy dengan mudah mendapat angka dan segera menyudahi gim kedua dengan skor 21-16.

Di gim penentu, Jonatan harus jatuh bangun untuk bisa mempertahankan keunggulannya atas Prannoy 6-4. Tapi kemudian, Prannoy berhasil membuat kedudukan imbang 7-7 dan berhasil unggul 11-8 pada interval ketiga.

Permainan berbeda ditunjukkan Jonatan selepas interval. Ia bangkit dan mengungguli Prannoy dengan skor 16-12. Tapi sayang kondisi itu tak berlangsung lama karena Prannoy mampu menyamakan angka 18-18.

Jonatan mendapat kesempatan game poin 20-18 tapi peluang itu ia sia-siakan setelah bola yang dipukulnya terlalu rendah dan menyangkut net.

Prannoy berhasil menikung angka Jonatan dengan berbalik unggul 21-20 setelah berhasil membuat deuce 20-20. Prannoy menambah dua angka 23-21 dan membuatnya keluar sebagai pemenang dalam duelnya bersama Jonatan di Toyota Thailand Open 2021.